19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2283 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  186  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  45.98 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1292  hypothetical protein  43.02 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  33.71 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  44.62 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1039  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000558059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3163  hypothetical protein  33.73 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.90075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  39.13 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  40.58 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  40.58 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  35.06 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  30.38 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  36.59 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  30.38 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  32.84 
 
 		 92 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>