More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2128 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 348 aa  692    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1627  rod shape-determining protein MreB  85.59 
 
 		 348 aa  597  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  82.9 
 
 		 346 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  71.26 
 
 		 346 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  70.54 
 
 		 342 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4023  rod shape-determining protein MreB  69.1 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  65.89 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  67.36 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  65.03 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  67.16 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0595  rod shape-determining protein MreB  65.58 
 
 		 345 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2010  rod shape-determining protein MreB  66.47 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0860436  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3645  rod shape-determining protein MreB  63.5 
 
 		 353 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  62.73 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  61.95 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  61.65 
 
 		 346 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  60.77 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0473  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.836992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  60.77 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  61.98 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  59 
 
 		 346 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  59.71 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  59.71 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2329  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  60.77 
 
 		 346 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1600  rod shape-determining protein MreB  63.25 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1003  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 		 346 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  59.28 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  58.21 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  58.98 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  58.33 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  58.33 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  58.98 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.63 
 
 		 344 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  59.17 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  58.98 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  58.98 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  58.33 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  59.28 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  59.28 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  57.86 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  59.28 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  60.53 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  57.44 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  57.57 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  58.68 
 
 		 345 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.19 
 
 		 345 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  58.68 
 
 		 345 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  57.88 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  57.74 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  58.68 
 
 		 345 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  56.85 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  57.8 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  56.85 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 349 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  58.54 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.12 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  59.33 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 345 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  57.44 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  59.63 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>