23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1690 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  56.94 
 
 		 156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  57.81 
 
 		 149 aa  147  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  41.04 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  36.81 
 
 		 182 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  41.43 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  41.18 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  36.42 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  38.26 
 
 		 178 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  40.17 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  40.82 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  37.78 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  33.86 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  31.71 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  31.3 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  29.7 
 
 		 146 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  27.68 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>