More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1408 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1408  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.883642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  83.47 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 125 aa  197  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  73.28 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  76.92 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  73.73 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  74.14 
 
 		 183 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  74.14 
 
 		 184 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  76.92 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  71.31 
 
 		 177 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  76.07 
 
 		 127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  71.79 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  71.79 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  72.5 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  75.21 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  70.94 
 
 		 145 aa  169  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  71.31 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  68.85 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  74.58 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  70.69 
 
 		 166 aa  167  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  70.49 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  70.49 
 
 		 126 aa  166  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  66.12 
 
 		 130 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  74.36 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  72.65 
 
 		 132 aa  163  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3884  50S ribosomal protein L19  77.59 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0241892  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2616  50S ribosomal protein L19  73.98 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  71.79 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 128 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  68.6 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  68.6 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  68.6 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  61.86 
 
 		 115 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  67.77 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  67.77 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  61.86 
 
 		 116 aa  147  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4186  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  66.12 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  65.81 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  64.66 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2705  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0571233 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1044  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 115 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  64.1 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 115 aa  143  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0185  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  63.93 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>