More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0832 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 178 aa  360  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  78.09 
 
 		 178 aa  292  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  77.65 
 
 		 179 aa  278  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  58.29 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  59.43 
 
 		 176 aa  209  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  59.43 
 
 		 176 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  59.43 
 
 		 176 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  59.43 
 
 		 176 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  58.86 
 
 		 176 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  58.86 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  58.86 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  59.09 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  59.09 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  59.09 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 176 aa  207  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 176 aa  207  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  57.14 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  57.23 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  58.05 
 
 		 177 aa  202  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  56.57 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 176 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  57.95 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  57.95 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 		 176 aa  200  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  56.57 
 
 		 174 aa  197  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  55.68 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  53.18 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 175 aa  194  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 		 176 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 175 aa  193  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 175 aa  193  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  53.18 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 182 aa  180  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  50.57 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  50.57 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  50.57 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  51.15 
 
 		 183 aa  177  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  50.57 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  48.28 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  50 
 
 		 181 aa  174  5e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  50 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  50 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  50 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  50 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  47.7 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  47.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  47.73 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  48.85 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  48.92 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  49.43 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>