61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_R0001 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  151  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.227787 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0001  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.560835  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  87.14 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  84.72 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0016  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0010  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  84.29 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0020  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0038  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0057  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0245889  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60310  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5361  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61830  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000100063  hitchhiker  0.00456196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0001  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0001  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0031  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.136071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  83.1 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  83.1 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0003  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579556  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0260915  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1376  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0043  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0012  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0055  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0012  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0130258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0045  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339043  hitchhiker  0.000000161581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0012  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0019  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000162954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0025  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532399  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>