19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0001 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.227787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0001  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.560835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0003  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0024  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>