20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4886 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4886  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4411  hypothetical protein  67.88 
 
 		 166 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4121  helix-turn-helix domain-containing protein  44.74 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  43.42 
 
 		 424 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 441 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  34.4 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6107  XRE family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0523  XRE family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 331 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  25.69 
 
 		 443 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  39.74 
 
 		 444 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  45.61 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  29.66 
 
 		 428 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 277 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  40 
 
 		 443 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  34.12 
 
 		 565 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 175 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  27.78 
 
 		 445 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 117 aa  42  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>