36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4116 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 		 350 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  85.01 
 
 		 350 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.82 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.23 
 
 		 399 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  38.87 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  37.96 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.9 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  31.69 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.14 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  32.75 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.53 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  34.62 
 
 		 361 aa  92.4  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30.29 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.26 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.29 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  33.18 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  40.85 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  41.23 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  33.9 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  37.21 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  36.59 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  33.09 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  34.35 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  35.77 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  37.4 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  34.35 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.43 
 
 		 596 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  29.96 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  20.53 
 
 		 377 aa  46.2  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.2 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.58 
 
 		 269 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.44 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  28 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  26.67 
 
 		 267 aa  43.5  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.06 
 
 		 386 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2513  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.77 
 
 		 219 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>