26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3366 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  100 
 
 		 512 aa  1045    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4001  Sporulation domain protein  38.92 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.512353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4200  sporulation domain-containing protein  39.04 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  37.38 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  37.33 
 
 		 483 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  37.14 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4082  sporulation domain-containing protein  38.93 
 
 		 483 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4111  sporulation domain-containing protein  38.7 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3696  sporulation domain-containing protein  37.02 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  normal  0.829888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3892  sporulation domain-containing protein  37.33 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598853  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  35.36 
 
 		 463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0249  sporulation domain-containing protein  36.22 
 
 		 464 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.899829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0240  sporulation domain-containing protein  35.7 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  37.79 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0263  sporulation related  34.2 
 
 		 511 aa  259  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0840788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  53.62 
 
 		 464 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  29.58 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  21.78 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  25.74 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  32.08 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  27.92 
 
 		 550 aa  53.9  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  26.61 
 
 		 533 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  23.67 
 
 		 548 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  22.81 
 
 		 551 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  24.9 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  26.36 
 
 		 541 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>