More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1680 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  100 
 
 
173 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  61.15 
 
 
155 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  61.15 
 
 
155 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  60.43 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  57.72 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  60.99 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  60.99 
 
 
160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  60.43 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  56.95 
 
 
155 aa  189  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  58.99 
 
 
160 aa  190  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  54.42 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  57.55 
 
 
155 aa  180  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  54.93 
 
 
171 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  54.61 
 
 
189 aa  174  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  52.78 
 
 
172 aa  164  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  43.29 
 
 
158 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  48.44 
 
 
182 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  47.2 
 
 
183 aa  141  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  43.62 
 
 
184 aa  140  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  38.95 
 
 
194 aa  130  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  39.38 
 
 
172 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  42.64 
 
 
160 aa  127  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  44.63 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  42.98 
 
 
174 aa  124  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  44.63 
 
 
172 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
165 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  32.41 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  30.41 
 
 
168 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  31.14 
 
 
173 aa  103  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  28.14 
 
 
167 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  29.1 
 
 
170 aa  101  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 
173 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  30.72 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  29.48 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  30.12 
 
 
173 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  29.48 
 
 
173 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 
173 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.2 
 
 
178 aa  94.4  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  32.5 
 
 
173 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  32.5 
 
 
173 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  32.54 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  31.67 
 
 
173 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  31.45 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
433 aa  92  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  31.3 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  32.54 
 
 
184 aa  91.3  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.85 
 
 
288 aa  90.9  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  28.17 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1612  redoxin domain-containing protein  29.75 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.75 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  35.58 
 
 
422 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.39 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  32.35 
 
 
188 aa  87.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  35.54 
 
 
198 aa  87  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.31 
 
 
168 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.93 
 
 
189 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 
280 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  33.93 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  29.5 
 
 
174 aa  85.5  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  32.87 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  33.61 
 
 
205 aa  85.1  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  32.2 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  32.87 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.83 
 
 
445 aa  84.3  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  31.78 
 
 
156 aa  84  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  29.46 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  31.78 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.99 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.9 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  36.09 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5957  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131947  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  32.17 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  25.81 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.63 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.05 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.24 
 
 
446 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  30.51 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  30.14 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  27.81 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25.56 
 
 
403 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  25.55 
 
 
403 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  35.19 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  29.41 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  36.44 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.61 
 
 
715 aa  80.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  33.82 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.53 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  30.51 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  32.52 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.66 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.86 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  33.82 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.23 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>