More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1902 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  64.14 
 
 		 199 aa  247  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  63.77 
 
 		 202 aa  243  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  55.68 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  57.83 
 
 		 194 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  51.85 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  50.79 
 
 		 189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  52.36 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  51.32 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  56.96 
 
 		 189 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  54.19 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  53.66 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  56.33 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  53.76 
 
 		 193 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  56.33 
 
 		 192 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  55.06 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  55.06 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  53.05 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 		 189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  52.17 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  55.06 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  55.06 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  54.66 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  54.43 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  54.04 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  55.06 
 
 		 192 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  54.43 
 
 		 190 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  55.28 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  58.86 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  53.42 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  53.8 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  53.8 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  58.23 
 
 		 189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  53.8 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  53.42 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  54.66 
 
 		 194 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  52.17 
 
 		 195 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  51.55 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  51.55 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  52.21 
 
 		 195 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  44.22 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 150 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  39.86 
 
 		 149 aa  111  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 149 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 149 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 149 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 151 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  106  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  43.15 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  44.93 
 
 		 148 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  43.8 
 
 		 148 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3462  ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  43.07 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  39.49 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1059  LSU ribosomal protein L9P / transcriptional regulator GntR family protein  47.79 
 
 		 152 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 170 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  42.18 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 147 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 150 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 150 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 150 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2763  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  40.15 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 149 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 149 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 149 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 150 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 149 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 149 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  36.99 
 
 		 149 aa  99.4  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 149 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 150 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 150 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 149 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 150 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 150 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 150 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 150 aa  98.6  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  98.6  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 148 aa  98.6  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>