More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1481 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1481  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2585  translation initiation factor IF-1  75.76 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4645  translation initiation factor IF-1  65.82 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7021  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.037971  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3132  translation initiation factor IF-1  55.56 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319222  normal  0.203192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1740  translation initiation factor IF-1  57.89 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5430  translation initiation factor IF-1  57.89 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1356  translation initiation factor IF-1  53.16 
 
 		 85 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3402  translation initiation factor IF-1  55.29 
 
 		 91 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0168888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0646  translation initiation factor IF-1  50.62 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0625  translation initiation factor IF-1  50.62 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.336813  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0981  translation initiation factor IF-1  51.9 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.359493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2954  translation initiation factor IF-1  50.63 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1792  translation initiation factor IF-1  51.28 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3512  translation initiation factor IF-1  53.95 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.684385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0399  translation initiation factor IF-1  49.43 
 
 		 93 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1183  translation initiation factor IF-1  54.67 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219123  normal  0.976132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1053  translation initiation factor IF-1  54.67 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0989  translation initiation factor IF-1  54.67 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0676628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3205  translation initiation factor IF-1  52.5 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.737724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0539  translation initiation factor 1  48.78 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.3184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4823  translation initiation factor IF-1  52 
 
 		 83 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.407366  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4193  translation initiation factor IF-1  56.06 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2961  translation initiation factor IF-1  55.38 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0227177  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2388  translation initiation factor IF-1  55.38 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4661  translation initiation factor IF-1  52 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0692274  normal  0.0189166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0509  translation initiation factor 1  50.63 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0312  translation initiation factor IF-1  54.55 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3704  translation initiation factor IF-1  54.55 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3906  translation initiation factor IF-1  56.92 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2034  translation initiation factor IF-1  52 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1670  translation initiation factor IF-1  52 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1086  translation initiation factor IF-1  51.35 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.27871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0662  translation initiation factor 1  56.25 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2872  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 72 aa  83.6  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0587815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0982  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 72 aa  83.6  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1130  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0438739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0587  translation initiation factor IF-1  50.77 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3585  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.974289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3557  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 72 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.177852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0775  translation initiation factor IF-1  52.31 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0735491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0211  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.939577 
 
 
-
 
NC_004310  BR0249  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.410715  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  54.69 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  58.06 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  58.06 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  54.69 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0267  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000603814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0640  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0323  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0270  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0242  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00952866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0187  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0211  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0526  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11892  normal  0.0775298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1057  translation initiation factor IF-1  54.55 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2239  translation initiation factor IF-1  54.55 
 
 		 72 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5211  translation initiation factor IF-1  48.65 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7886  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1285  translation initiation factor IF-1  52.78 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1346  translation initiation factor IF-1  52.78 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  58.06 
 
 		 72 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2051  translation initiation factor IF-1  53.03 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2444  translation initiation factor IF-1  53.03 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.546311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5176  translation initiation factor IF-1  55.38 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.411739  normal  0.733527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1932  translation initiation factor IF-1  53.12 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000750543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0758  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1676  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.446088 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5188  translation initiation factor IF-1  57.81 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4408  translation initiation factor IF-1  53.25 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0626  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  53.12 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2278  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414764  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0599  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5742  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4110  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1688  translation initiation factor 1  56.25 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000115833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1916  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2139  translation initiation factor IF-1  54.84 
 
 		 72 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1463  translation initiation factor IF-1  49.3 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  53.03 
 
 		 72 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0288  translation initiation factor IF-1  50 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5900  translation initiation factor IF-1  54.55 
 
 		 72 aa  76.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0788  translation initiation factor IF-1  53.23 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3352  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0756524  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5094  translation initiation factor IF-1  49.37 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5765  translation initiation factor IF-1  49.37 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1790  translation initiation factor IF-1  53.12 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684782  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0700  translation initiation factor IF-1  53.23 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0196  translation initiation factor IF-1  58.06 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1734  translation initiation factor IF-1  53.97 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  50 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  54.1 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  56.25 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>