More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5900 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5900  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  144  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
75 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1790  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  105  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  105  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  68.06 
 
 
73 aa  104  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4222  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0496  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  0.000000000845588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  0.0000000000154943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3928  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0300  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000294229  hitchhiker  0.0000161331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  65.28 
 
 
85 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 
75 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 
75 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2998  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2611  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.430163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  65.28 
 
 
72 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1945  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0074  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
73 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3499  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3148  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655502  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  68.57 
 
 
73 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
73 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  68.06 
 
 
72 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
73 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 
72 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 
73 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 
72 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  59.15 
 
 
71 aa  100  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 
72 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  100  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  100  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 
72 aa  100  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
73 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
74 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0421  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
74 aa  100  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  68.57 
 
 
73 aa  100  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
73 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 
72 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 
73 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  56.94 
 
 
72 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 
72 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>