More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20640 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  100 
 
 		 73 aa  148  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  89.04 
 
 		 73 aa  138  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  89.04 
 
 		 73 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  89.04 
 
 		 73 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  87.67 
 
 		 73 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  87.67 
 
 		 73 aa  137  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2659  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2944  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  86.3 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1212  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  133  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3117  translation initiation factor IF-1  82.19 
 
 		 73 aa  132  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1137  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04210  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.554709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1108  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1125  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.609417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1431  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  84.93 
 
 		 73 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  84.93 
 
 		 73 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3674  translation initiation factor IF-1  83.56 
 
 		 111 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4484  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  82.19 
 
 		 73 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6588  translation initiation factor IF-1  86.3 
 
 		 73 aa  131  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  82.19 
 
 		 73 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3900  translation initiation factor IF-1  82.19 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0605  translation initiation factor IF-1  84.93 
 
 		 73 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  82.19 
 
 		 73 aa  130  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6026  translation initiation factor IF-1  84.93 
 
 		 73 aa  130  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  82.19 
 
 		 73 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1167  translation initiation factor IF-1  84.93 
 
 		 73 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4291  translation initiation factor IF-1  82.19 
 
 		 73 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.525945  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23570  translation initiation factor 1  84.93 
 
 		 73 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16940  translation initiation factor 1  84.93 
 
 		 76 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  83.56 
 
 		 73 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  82.19 
 
 		 73 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  79.45 
 
 		 73 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 		 72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 		 72 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  79.45 
 
 		 73 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 		 72 aa  115  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 		 73 aa  114  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  75.34 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 		 73 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 73 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000185401  hitchhiker  0.0000121311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1567  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216088  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000441165  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  72.6 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  73.97 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2531  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132982  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  73.97 
 
 		 72 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000358057  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000207147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 		 72 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 		 73 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  71.23 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 		 72 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>