More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0395 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  100 
 
 		 161 aa  335  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  56.49 
 
 		 188 aa  202  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  58.82 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  61.33 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  60 
 
 		 172 aa  200  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  60 
 
 		 172 aa  200  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  60.67 
 
 		 201 aa  198  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  59.48 
 
 		 165 aa  197  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  58.55 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  57.52 
 
 		 174 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  56.86 
 
 		 166 aa  193  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  56.49 
 
 		 162 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  55.84 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  55.84 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  55.84 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  55.84 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  55.84 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  55.84 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  55.19 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  56.67 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  56.29 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  56.29 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  54.19 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  56.08 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  53.25 
 
 		 156 aa  177  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  55.19 
 
 		 164 aa  177  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  53.69 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  55.41 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  52.6 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  52.6 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  52.6 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  52.6 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  52.6 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  54.3 
 
 		 161 aa  174  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  57.24 
 
 		 160 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  51.95 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  54.48 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  54 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  52.94 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  51.57 
 
 		 160 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  53.64 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  52.94 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  50.99 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  52.29 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  50.33 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  50.97 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  51.61 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  51.61 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  51.95 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  51.63 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  51.63 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  50.97 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  50.33 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  50.32 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  50.33 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  49.67 
 
 		 157 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  49.67 
 
 		 157 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  50.98 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  51.32 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  50.33 
 
 		 180 aa  158  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  51.32 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  50 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  49.67 
 
 		 180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  50.65 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  50.65 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29571  Dps protein family protein  51.72 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  49.68 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  49.36 
 
 		 157 aa  150  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  51.68 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  46.45 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  46.75 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  46.75 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  45.81 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  45.81 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  45.81 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  45.81 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  46.75 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  46.1 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  42.21 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  46.43 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  46.43 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4306  Ferritin Dps family protein  44.52 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  42.38 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4078  Ferritin and Dps  45.27 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0913  Ferritin and Dps  45.27 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0256847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  42.36 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  37.91 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6002  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  39.22 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  36.08 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  38.19 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  39.71 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2721  Ferritin and Dps  41.43 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  34.18 
 
 		 169 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  37.41 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  39.71 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  36.62 
 
 		 158 aa  98.6  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3839  Ferritin Dps family protein  37.86 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  38.73 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0319  Ferritin Dps family protein  37.32 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>