More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0381 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  72.47 
 
 		 309 aa  277  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  72.47 
 
 		 309 aa  277  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  72.47 
 
 		 375 aa  276  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  72.47 
 
 		 309 aa  274  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  72.47 
 
 		 309 aa  274  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  72.47 
 
 		 309 aa  274  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  71.91 
 
 		 309 aa  273  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  71.19 
 
 		 309 aa  271  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  71.91 
 
 		 309 aa  269  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  71.35 
 
 		 235 aa  264  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  69.66 
 
 		 306 aa  258  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  73.89 
 
 		 393 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  62.71 
 
 		 309 aa  235  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  62.71 
 
 		 309 aa  235  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  62.71 
 
 		 309 aa  235  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  69.87 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  69.87 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  60.99 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  62.15 
 
 		 290 aa  231  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  69.23 
 
 		 269 aa  231  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  62.15 
 
 		 290 aa  231  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  69.23 
 
 		 269 aa  231  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  61.11 
 
 		 290 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  68.59 
 
 		 260 aa  228  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  62.01 
 
 		 312 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  61.36 
 
 		 290 aa  225  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  61.36 
 
 		 290 aa  225  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  61.68 
 
 		 309 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  69.87 
 
 		 284 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  67.97 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  67.97 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  67.97 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  67.97 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  67.97 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  65.22 
 
 		 372 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  73.81 
 
 		 231 aa  200  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  60.13 
 
 		 264 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  61.04 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1946  integrase catalytic region  51.08 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  70.08 
 
 		 237 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  70.08 
 
 		 237 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  70.08 
 
 		 237 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  70.08 
 
 		 237 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  62.77 
 
 		 274 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  64.52 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 276 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 276 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 276 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 276 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4081  integrase catalytic region  50.97 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0001  integrase core subunit  50.97 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.274298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  48.78 
 
 		 280 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  51.95 
 
 		 274 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  51.61 
 
 		 274 aa  161  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  50.32 
 
 		 276 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  45.51 
 
 		 269 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  50.32 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  50.32 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  50.32 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  50.32 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  48.72 
 
 		 276 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  50.32 
 
 		 281 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  49.36 
 
 		 277 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4648  integrase catalytic region  49.36 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1715  IS407A, transposase OrfB  49.36 
 
 		 277 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0670836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>