28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0279 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0279  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 581 aa  1142    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1098  hypothetical protein  30.88 
 
 		 595 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  28.36 
 
 		 606 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  26.16 
 
 		 600 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4033  hypothetical protein  26.47 
 
 		 596 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  25.64 
 
 		 605 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2298  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 616 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  26.15 
 
 		 603 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  24.64 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5145  hypothetical protein  26.61 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4455  hypothetical protein  46.88 
 
 		 191 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3240  hypothetical protein  40.34 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5936  TPR repeat-containing protein  45 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0246268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5239  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1109  putative PAS/PAC sensor protein  40.87 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1711  hypothetical protein  35.04 
 
 		 414 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99847  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2138  putative PAS/PAC sensor protein  43.9 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4048  hypothetical protein  36.56 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.04 
 
 		 596 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  30.41 
 
 		 581 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5072  hypothetical protein  35.96 
 
 		 594 aa  54.3  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1212  hypothetical protein  36.15 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  32.29 
 
 		 602 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 923 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  22.64 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5021  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.15 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.667321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.77 
 
 		 264 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>