27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0051 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0051  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 290 bp  575  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000411974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    94.44 
 
 		 344 bp  56  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 285 bp  54  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    96.55 
 
 		 347 bp  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 326 bp  50.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 339 bp  50.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 301 bp  50.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  96.55 
 
 		 340 bp  50.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0071  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 338 bp  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.202054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 345 bp  50.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    96.55 
 
 		 350 bp  50.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2566  hypothetical protein  96.55 
 
 		 966 bp  50.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000598494  normal  0.490219 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    96.55 
 
 		 347 bp  50.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 328 bp  50.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 347 bp  50.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 316 bp  50.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  96.55 
 
 		 347 bp  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 304 bp  50.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 347 bp  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0004  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 281 bp  50.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000603454  normal  0.0636822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 350 bp  50.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 347 bp  50.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0003  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 283 bp  50.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000142891  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_R0055    93.75 
 
 		 320 bp  48.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  93.75 
 
 		 353 bp  48.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 306 bp  46.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0009  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 348 bp  46.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>