35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2566 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2566  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000598494  normal  0.490219 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3356  hypothetical protein  68.54 
 
 
275 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000221362  hitchhiker  0.00000177169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0603  hypothetical protein  69.29 
 
 
275 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00959677  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1231  hypothetical protein  60.22 
 
 
354 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000281184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2421  hypothetical protein  60.22 
 
 
377 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3423  hypothetical protein  60.75 
 
 
371 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3416  hypothetical protein  60.75 
 
 
371 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.630747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2608  hypothetical protein  60.22 
 
 
286 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3381  hypothetical protein  60.75 
 
 
280 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1198  hypothetical protein  60.22 
 
 
286 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0337  hypothetical protein  60.22 
 
 
286 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2707  hypothetical protein  57.46 
 
 
293 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0643  hypothetical protein  58.09 
 
 
296 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208458  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0676  hypothetical protein  57.35 
 
 
296 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0193  hypothetical protein  61.06 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.502309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0465  putative transmembrane protein  49.25 
 
 
266 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0011983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0364  putative transmembrane protein  51.31 
 
 
266 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0428854  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0488  putative transmembrane protein  48.72 
 
 
270 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0379  putative transmembrane protein  51.72 
 
 
265 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494344  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0407  hypothetical protein  46.79 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851089  normal  0.0723479 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2062  hypothetical protein  35.92 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2385  hypothetical protein  34.29 
 
 
351 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.370003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4317  putative transmembrane protein  43.3 
 
 
273 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0858  putative transmembrane protein  44.83 
 
 
246 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3024  putative transmembrane protein  40.23 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.931327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3743  putative transmembrane protein  41.2 
 
 
257 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1031  putative transmembrane protein  42.44 
 
 
267 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.14638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1387  putative transmembrane protein  42.55 
 
 
269 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3449  putative transmembrane protein  46.01 
 
 
224 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0669267  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0508  putative transmembrane protein  37.1 
 
 
258 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0885  putative transmembrane protein  37.34 
 
 
262 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.968622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0076  hypothetical protein  37.81 
 
 
277 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02719  probable putative transmembrane protein  32.34 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2953  hypothetical protein  32.71 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00176502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2864  putative putative transmembrane protein  33.79 
 
 
278 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>