24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1617 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1617  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 378 aa  738    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  25.27 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  21.84 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 443 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  21.4 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  23.6 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.05 
 
 		 493 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  17.52 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  17.52 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  18.49 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.22 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0773  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00492916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  20.81 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  20.64 
 
 		 466 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  19.47 
 
 		 426 aa  42.7  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>