More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0524 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 432 aa  880    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1134  adenylosuccinate synthetase  57.65 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  49.88 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  48.26 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  51.42 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 449 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  48.12 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  52.13 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  48.46 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  48.25 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  46.14 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 444 aa  408  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  46.26 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  51.78 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  46.21 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  47.48 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  48.7 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  47.48 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  46.6 
 
 		 434 aa  405  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  47.31 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  47.67 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0966  Adenylosuccinate synthase  47.22 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  45.54 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  47.17 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  44.81 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  46.57 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  45.75 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  45.67 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  47.11 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  47.25 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  46.99 
 
 		 430 aa  398  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  46.57 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0867  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000883365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  47.58 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1889  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>