51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4681 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4681  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 392 aa  809    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4278  glycosyl transferase group 1  95.09 
 
 		 385 aa  739    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4473  glycosyl transferase group 1  94.9 
 
 		 390 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4333  glycosyl transferase group 1  95.15 
 
 		 390 aa  746    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3985  glycosyl transferase, group 1  96.94 
 
 		 390 aa  759    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0595818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0109  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.68 
 
 		 402 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84899  normal  0.0173656 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1459  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00514335  hitchhiker  0.00279802 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0456  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  hitchhiker  0.00671618 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25.79 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  31.18 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3569  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 460 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1802  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  24.59 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 357 aa  49.7  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2082  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2090  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02940  polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.41 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.61 
 
 		 352 aa  46.6  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.44 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  22.32 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  26.88 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  27.7 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  23.81 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  21.08 
 
 		 360 aa  43.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 393 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  26.77 
 
 		 382 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  24.22 
 
 		 385 aa  42.7  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>