More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4290 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
278 aa  553  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  86.64 
 
 
283 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  81.29 
 
 
281 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  72.73 
 
 
284 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  70.44 
 
 
287 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  70.07 
 
 
287 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  70.07 
 
 
289 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  51.27 
 
 
274 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  50.91 
 
 
274 aa  262  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.37 
 
 
282 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.93 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2832  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.77 
 
 
294 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1603  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.98 
 
 
291 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0162233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.98 
 
 
282 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.43 
 
 
278 aa  221  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1964  phosphate ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
292 aa  218  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.49 
 
 
596 aa  209  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  47.13 
 
 
283 aa  206  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0582  phosphate ABC transporter permease  40.44 
 
 
277 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.06 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  46.64 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.52 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  41.16 
 
 
649 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.27 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176933  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.79 
 
 
646 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.78 
 
 
287 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0454  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.93 
 
 
294 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.36 
 
 
294 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.68 
 
 
645 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  39.93 
 
 
297 aa  178  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.62 
 
 
306 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.28 
 
 
604 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  38.93 
 
 
627 aa  176  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  41.64 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1879  ABC-type phosphate transport system, permease component  35.84 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.43 
 
 
284 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40 
 
 
288 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.29 
 
 
309 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.63 
 
 
284 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1008  ABC-type phosphate transport system, permease component  32.76 
 
 
294 aa  169  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  37.36 
 
 
291 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl234  phosphate ABC transporter permease component  37.5 
 
 
715 aa  169  6e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  37.23 
 
 
297 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0990  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  32.76 
 
 
295 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.164904  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0484  phosphate ABC transporter, permease, putative  37.02 
 
 
696 aa  167  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0317247  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28120  phosphate ABC transporter membrane protein  39.57 
 
 
285 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0591  ABC-type phosphate transport system, permease component  34.14 
 
 
294 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0222  phosphate ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 
478 aa  167  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.017754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1953  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.51 
 
 
294 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.22501  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.41 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.55 
 
 
289 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.59 
 
 
284 aa  165  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4585  putative phosphate ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
306 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.206846 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.31 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.8 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0558  ABC-type phosphate transport system, permease component  33.85 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0549  ABC-type phosphate transport system, permease component  33.1 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00903188  hitchhiker  2.03288e-22 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.8 
 
 
293 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0019112  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.23 
 
 
290 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1930  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.43 
 
 
282 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.19172  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.57 
 
 
288 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.55 
 
 
358 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.61 
 
 
270 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.21 
 
 
305 aa  158  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  42.37 
 
 
307 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0752  putative phosphate ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
306 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0786  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  34.75 
 
 
306 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0177  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.22 
 
 
307 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0633  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.22 
 
 
306 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.454449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.4 
 
 
309 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2394  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.46 
 
 
304 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.73 
 
 
448 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0683  phosphate ABC transporter permease  34.75 
 
 
306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0627  phosphate ABC transporter, permease  34.75 
 
 
306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0627  phosphate ABC transporter, permease  34.75 
 
 
306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0846  putative phosphate ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0717  phosphate ABC transporter permease  34.75 
 
 
306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0772  putative phosphate ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000179508 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.68 
 
 
449 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.74 
 
 
304 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0113  phosphate ABC transporter permease  33.44 
 
 
310 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4004  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  37.35 
 
 
304 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.757198  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.43 
 
 
370 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.38 
 
 
305 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.05 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.36 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.35 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.86 
 
 
284 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1993  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.23 
 
 
295 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0126  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.3 
 
 
279 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  36.82 
 
 
364 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1509  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.89 
 
 
276 aa  152  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4580  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.33 
 
 
294 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  0.447387 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.61 
 
 
448 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4078  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  32.95 
 
 
293 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21610  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  46.78 
 
 
200 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  33.45 
 
 
361 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1558  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.04 
 
 
276 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.08 
 
 
281 aa  148  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  34.66 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>