36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4130 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  94.81 
 
 		 156 aa  285  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  94.81 
 
 		 156 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  94.81 
 
 		 156 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  89.61 
 
 		 156 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  81.17 
 
 		 156 aa  260  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  81.17 
 
 		 156 aa  260  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  81.17 
 
 		 156 aa  260  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  80.52 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  78.95 
 
 		 153 aa  244  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  74.67 
 
 		 159 aa  234  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  72.55 
 
 		 153 aa  234  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  75.68 
 
 		 157 aa  226  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  69.39 
 
 		 155 aa  226  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  71.62 
 
 		 159 aa  224  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  65.1 
 
 		 153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  30 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  27.66 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  30.61 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  27.03 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  26.14 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  26.17 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  28.37 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  29.17 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  30.72 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.66 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  32.26 
 
 		 464 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  31.43 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.66 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  29.13 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  32.26 
 
 		 462 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  24.48 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  29.08 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  24.48 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  29.73 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  28.21 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>