47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2118 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  81.91 
 
 		 94 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  81.91 
 
 		 94 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  81.91 
 
 		 94 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  79.79 
 
 		 96 aa  156  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  65.96 
 
 		 97 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  45.74 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.08 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  31.18 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  36.14 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  32.95 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  32.95 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  32.61 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  32.95 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  33.33 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  32.2 
 
 		 350 aa  47.4  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.72 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  31.4 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  27.47 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  29.35 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  31.03 
 
 		 351 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  30 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  30.65 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  25.53 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  30.16 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  25 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  25 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.97 
 
 		 129 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>