More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1686 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  55.09 
 
 
683 aa  770    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.02 
 
 
682 aa  1097    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1686  prolyl oligopeptidase family protein  100 
 
 
678 aa  1394    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  59.82 
 
 
675 aa  824    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.453566  normal  0.217574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  52.53 
 
 
677 aa  737    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.73 
 
 
682 aa  1092    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  91.12 
 
 
677 aa  1271    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.17 
 
 
682 aa  1098    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  90.98 
 
 
677 aa  1272    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  83.43 
 
 
676 aa  1161    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  78.17 
 
 
682 aa  1098    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  90.83 
 
 
677 aa  1270    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1383  prolyl oligopeptidase family protein  58.12 
 
 
686 aa  793    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  60.78 
 
 
683 aa  823    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.5 
 
 
644 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.34 
 
 
644 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  39.29 
 
 
644 aa  492  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.22 
 
 
646 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.91 
 
 
643 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  39.4 
 
 
643 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.1 
 
 
644 aa  465  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.07 
 
 
655 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.75 
 
 
644 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1344  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.72 
 
 
629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  37.62 
 
 
643 aa  436  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0608  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  39.59 
 
 
645 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.95 
 
 
662 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.956519  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0459  prolyl oligopeptidase family protein  37.62 
 
 
636 aa  422  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1709  peptidase catalytic subunit  37.46 
 
 
636 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1489  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.11 
 
 
646 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.475976  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  35.81 
 
 
665 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.57 
 
 
693 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.85 
 
 
643 aa  379  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.18 
 
 
642 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.77 
 
 
668 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.48 
 
 
626 aa  340  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  33.38 
 
 
661 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.72 
 
 
719 aa  319  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0587  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.8 
 
 
623 aa  313  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30410  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  32.09 
 
 
702 aa  307  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19830  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  32.88 
 
 
641 aa  307  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646279  hitchhiker  0.000217512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41620  peptidase  32.98 
 
 
651 aa  304  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4675  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.9 
 
 
608 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637214  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5162  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.05 
 
 
574 aa  300  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.05 
 
 
607 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.7 
 
 
607 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  33.33 
 
 
612 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.91 
 
 
607 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03061  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.44 
 
 
652 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0508  hypothetical protein  32.58 
 
 
610 aa  283  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3161  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.07 
 
 
662 aa  277  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464305  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3453  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.07 
 
 
640 aa  273  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000252279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.25 
 
 
652 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  30.21 
 
 
608 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00771  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.76 
 
 
645 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.248963  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38770  putative peptidase  30.99 
 
 
608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0408  putative peptidase  31.35 
 
 
639 aa  253  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2275  putative peptidase  31.37 
 
 
635 aa  247  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.573468  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01331  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.24 
 
 
644 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.180596  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.96 
 
 
663 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956088  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1432  dienelactone hydrolase  28.91 
 
 
644 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.839365  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00781  esterase/lipase/thioesterase family protein  25 
 
 
642 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00811  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.21 
 
 
641 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00801  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.99 
 
 
641 aa  203  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0071  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.65 
 
 
641 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1960  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.74 
 
 
610 aa  187  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.317631  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.14 
 
 
656 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.39 
 
 
633 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.63 
 
 
656 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  28.96 
 
 
640 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  31.05 
 
 
655 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  31.69 
 
 
694 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.04 
 
 
617 aa  124  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.19 
 
 
644 aa  124  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.86 
 
 
632 aa  124  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.76 
 
 
705 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.2 
 
 
632 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.91 
 
 
594 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.34 
 
 
638 aa  120  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.49 
 
 
668 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.86 
 
 
642 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.08 
 
 
645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.63 
 
 
731 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.64 
 
 
630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 
626 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.74 
 
 
629 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.22 
 
 
626 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.66 
 
 
645 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.89 
 
 
655 aa  114  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.66 
 
 
645 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.29 
 
 
600 aa  113  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  30.87 
 
 
653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.18 
 
 
653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.83 
 
 
667 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.74 
 
 
706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  30.43 
 
 
678 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.55 
 
 
634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.03 
 
 
907 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  31.19 
 
 
759 aa  111  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.97 
 
 
641 aa  111  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>