More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1277 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  78.05 
 
 		 164 aa  278  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  78.05 
 
 		 164 aa  278  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  64.63 
 
 		 166 aa  230  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  64.63 
 
 		 166 aa  229  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  64.63 
 
 		 166 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  64.02 
 
 		 166 aa  227  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  66.45 
 
 		 166 aa  221  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  65.81 
 
 		 166 aa  219  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  65.16 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  65.16 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  65.16 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  65.16 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  65.16 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  60 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  60 
 
 		 166 aa  200  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  52.56 
 
 		 167 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  52.56 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  55.84 
 
 		 171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  50.92 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  52.6 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  54.9 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  51.57 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  52.83 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 171 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  49.08 
 
 		 171 aa  174  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.47 
 
 		 171 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  47.85 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  47.24 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  46.91 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  44.79 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  45.86 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  44.17 
 
 		 232 aa  154  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  46.3 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  48.15 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.9 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  43.71 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  44.85 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.1 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.85 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  43.11 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  43.11 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.11 
 
 		 187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.64 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  44.24 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  42.07 
 
 		 197 aa  144  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.82 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.82 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  45.51 
 
 		 168 aa  144  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.82 
 
 		 197 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  42.77 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  41.21 
 
 		 197 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  41.21 
 
 		 197 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  46.41 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  43.67 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  42.68 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  46.58 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.21 
 
 		 197 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.37 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  40.85 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  40.85 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.07 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  42.07 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  41.46 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  44.31 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  46.31 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  43.11 
 
 		 167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  43.11 
 
 		 167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  39.76 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  42.28 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  40.48 
 
 		 181 aa  137  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  41.57 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.64 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  42.51 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  42.51 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  47.33 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.98 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  42.77 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.55 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  41.36 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  40.96 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  40.96 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  41.92 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  38.55 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  39.16 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.96 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  40.96 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.96 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  42.51 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  40.85 
 
 		 179 aa  134  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>