19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2592 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2592  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  367  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  24.31 
 
 
304 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0919  hypothetical protein  28.72 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000270991  unclonable  1.59322e-23 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  21.24 
 
 
214 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  30.07 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  26.95 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04400  hypothetical protein  29.19 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  27.94 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  40.74 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  31.09 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  30.68 
 
 
232 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  22.4 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  27.27 
 
 
196 aa  45.1  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  24.87 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  28.12 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  27.85 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  27.03 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  27.94 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  22.94 
 
 
267 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>