More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1559 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1559  peptidase M24  100 
 
 
436 aa  899    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4752  aminopeptidase, putative  37.75 
 
 
435 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00197611  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2916  peptidase M24  40.05 
 
 
415 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5108  peptidase M24  40.15 
 
 
434 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239431  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3167  peptidase M24  36.67 
 
 
422 aa  249  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0354  peptidase M24  35.97 
 
 
419 aa  249  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2381  peptidase M24  38.97 
 
 
427 aa  243  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2884  peptidase M24  34.81 
 
 
425 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1779  peptidase M24  35.11 
 
 
443 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0971703  normal  0.379235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5287  peptidase M24  34.37 
 
 
426 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.912163  normal  0.238252 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4843  peptidase M24  33.85 
 
 
426 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1016  peptidase M24  32.33 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116429  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  29.76 
 
 
415 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2110  peptidase M24  29.06 
 
 
428 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0590999  normal  0.141965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  27.55 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  28.12 
 
 
433 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  28.72 
 
 
449 aa  143  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2880  peptidase M24  30.63 
 
 
424 aa  126  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  29.07 
 
 
429 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2852  Xaa-Pro aminopeptidase-like protein  35.96 
 
 
229 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141888  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4231  peptidase M24  27.23 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  31.11 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  25.26 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.13 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  29.96 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  24.87 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  25.59 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3764  peptidase M24  26.75 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3837  peptidase M24  26.75 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  27.13 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3776  peptidase M24  26.75 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367496  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  26.17 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  29.41 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  26.17 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  23.8 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  24.18 
 
 
373 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  27.89 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  25.57 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  25 
 
 
353 aa  77  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  24.47 
 
 
356 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  23.26 
 
 
356 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  23.8 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  23.8 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  23.8 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  24.33 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  28.05 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  23.8 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  27.24 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  23.8 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  23.55 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0525  peptidase M24  25.36 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.91 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  25.77 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  25.58 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.91 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.47 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.24 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.91 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.91 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.02 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.91 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  26.28 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.24 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  26.36 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1982  xaa-pro aminopeptidase, putative  26.14 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.96 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  25.2 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.24 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.1 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0152  aminopeptidase P  26.42 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.24 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.24 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.24 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.24 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  23.55 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.5 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2854  xaa-pro aminopeptidase  26.48 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  23.44 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  27.76 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  24.48 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2539  xaa-pro aminopeptidase  26.48 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2421  peptidase M24  27.09 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549884  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  27.92 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.92 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  25.89 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  23.35 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.02 
 
 
359 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  26.32 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  26.32 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.92 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.22 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  25.36 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  27.02 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  24.18 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  24.42 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  22.99 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2242  putative endopeptidase  24.31 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  26.64 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2132  putative endopeptidase  24.31 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  23.06 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>