17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3201 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1239    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  41.19 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  26.61 
 
 
617 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  27.04 
 
 
618 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  25.16 
 
 
612 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  24.6 
 
 
609 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  26 
 
 
623 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  24.8 
 
 
636 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0940  hypothetical protein  37.5 
 
 
254 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2166  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  23.01 
 
 
613 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  21.28 
 
 
525 aa  99  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  22.42 
 
 
632 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0460  hypothetical protein  22.82 
 
 
493 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  21.28 
 
 
610 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  24.19 
 
 
355 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  26.19 
 
 
701 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  29.87 
 
 
689 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>