27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1587 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  634    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  634    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  75.91 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  39.39 
 
 		 342 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  44.94 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  41.3 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  39.88 
 
 		 389 aa  175  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  28.67 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  37.35 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  40.26 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3934  sporulation domain-containing protein  40.26 
 
 		 264 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  39.47 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  36.36 
 
 		 467 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  26.61 
 
 		 990 aa  50.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0790  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.21 
 
 		 489 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  34.72 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  34.25 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  31.65 
 
 		 470 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  36.49 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  26.61 
 
 		 978 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  34.21 
 
 		 198 aa  45.8  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2218  sporulation domain-containing protein  39.33 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  33.78 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  23.33 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  34.18 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  30.59 
 
 		 966 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5343  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.14 
 
 		 494 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>