More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4097 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  888    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  77.58 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  58.67 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  50.22 
 
 		 473 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  49.36 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  48.47 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  47.03 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.06 
 
 		 474 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47 
 
 		 474 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.9 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.82 
 
 		 510 aa  352  8e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.06 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  42.76 
 
 		 472 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  50.96 
 
 		 469 aa  339  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  47.89 
 
 		 499 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  42.39 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  42.39 
 
 		 477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.12 
 
 		 484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  45.29 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  48.54 
 
 		 499 aa  336  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.39 
 
 		 475 aa  335  7e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  45.76 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  42.17 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  41.33 
 
 		 478 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  41.74 
 
 		 477 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.5 
 
 		 472 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  42.06 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.65 
 
 		 490 aa  313  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  41.74 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.53 
 
 		 1553 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  25.7 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3596  phosphoglucosamine mutase  32.29 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  27.08 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  27.08 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  26.6 
 
 		 448 aa  106  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  27.27 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  25.58 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  25.93 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  27.85 
 
 		 448 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  27.22 
 
 		 448 aa  100  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  27.45 
 
 		 448 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  27.55 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  27.45 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  28.16 
 
 		 448 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  27.75 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  27.75 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  27.75 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  27.75 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  27.75 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  27.75 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  27.75 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  27.67 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  31.93 
 
 		 451 aa  97.8  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  29.25 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  28.9 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  29.17 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  27.62 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.33 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  26.53 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  28.48 
 
 		 480 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.29 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  27.74 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  29.74 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  27.67 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.1 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  26.96 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0030  phosphoglucosamine mutase  23.8 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000444071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  30.79 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29340  phosphoglucosamine mutase  32.13 
 
 		 452 aa  90.9  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  27.35 
 
 		 447 aa  90.9  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  29.38 
 
 		 445 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  25.73 
 
 		 449 aa  90.1  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0512  Phosphoglucosamine mutase  29.24 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  29.57 
 
 		 455 aa  89.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  27.11 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  26.58 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  26.88 
 
 		 453 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  29.45 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  27.79 
 
 		 451 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0897  phosphoglucosamine mutase  29.58 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.05706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  30.09 
 
 		 450 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1578  phosphoglucosamine mutase  27.69 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.840977  normal  0.129452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  28.82 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  29.27 
 
 		 469 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  26.58 
 
 		 451 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  26.58 
 
 		 451 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  29.03 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  26.11 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  29.18 
 
 		 448 aa  86.7  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  31.16 
 
 		 456 aa  86.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  23.87 
 
 		 467 aa  86.7  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  29.72 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1419  phosphoglucosamine mutase  25.48 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0124783  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  25.68 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  28.92 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1095  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  27.48 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3769  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00158807  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  29.5 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>