More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1419 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1419  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
428 aa  860    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0124783  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0897  phosphoglucosamine mutase  58.74 
 
 
432 aa  519  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.05706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0764  phosphoglucosamine mutase  49.02 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.882404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0030  phosphoglucosamine mutase  47.03 
 
 
440 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000444071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0740  phosphoglucosamine mutase  48.54 
 
 
429 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  44.12 
 
 
444 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  45.27 
 
 
449 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  46.17 
 
 
459 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  47.51 
 
 
447 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  45.12 
 
 
445 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  43.82 
 
 
449 aa  353  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  43.62 
 
 
451 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  42.09 
 
 
451 aa  349  4e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  45.39 
 
 
448 aa  349  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  42.66 
 
 
444 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  45.39 
 
 
448 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  41.96 
 
 
452 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  42.7 
 
 
460 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  41.95 
 
 
446 aa  338  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  43.24 
 
 
449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  43.22 
 
 
450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  42.28 
 
 
449 aa  336  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  43.37 
 
 
451 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  40.36 
 
 
450 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  41.04 
 
 
450 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  40.98 
 
 
455 aa  330  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  39.73 
 
 
450 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  42.7 
 
 
454 aa  329  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  40.27 
 
 
451 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  41.57 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  42.02 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  41.74 
 
 
451 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  42.25 
 
 
454 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  42.7 
 
 
451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  41 
 
 
450 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  42.21 
 
 
446 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  41.03 
 
 
447 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  40.82 
 
 
448 aa  326  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  40.82 
 
 
448 aa  326  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  40.05 
 
 
459 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  41.34 
 
 
448 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  40.72 
 
 
451 aa  325  9e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  40.72 
 
 
451 aa  325  9e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  41.51 
 
 
446 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1578  phosphoglucosamine mutase  42.12 
 
 
436 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.840977  normal  0.129452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  40.59 
 
 
448 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  41.34 
 
 
448 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  39.69 
 
 
451 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  40.82 
 
 
448 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  40.82 
 
 
448 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  40.82 
 
 
448 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  40.82 
 
 
448 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  40.82 
 
 
448 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  40.59 
 
 
448 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  40.82 
 
 
448 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  40.82 
 
 
448 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  41.35 
 
 
453 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  41.27 
 
 
446 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  39.09 
 
 
450 aa  322  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  40.72 
 
 
448 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  41.23 
 
 
446 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  41.45 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  41.7 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  42.22 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  37.3 
 
 
439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  40.14 
 
 
449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  42.01 
 
 
442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  41.04 
 
 
446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  41.04 
 
 
446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  41.55 
 
 
446 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03830  phosphoglucosamine mutase  42.35 
 
 
447 aa  320  3e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  40.4 
 
 
458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  42.5 
 
 
445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  41.59 
 
 
445 aa  319  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  40.27 
 
 
449 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  39.12 
 
 
461 aa  318  7.999999999999999e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  42.12 
 
 
447 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  40.62 
 
 
496 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  40.58 
 
 
496 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1148  phosphoglucosamine mutase  38.53 
 
 
470 aa  317  2e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  40.45 
 
 
445 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  42.12 
 
 
455 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  42.12 
 
 
455 aa  316  4e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  40.5 
 
 
483 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  38.27 
 
 
444 aa  315  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  39.37 
 
 
453 aa  315  8e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21950  phosphoglucosamine mutase  37.61 
 
 
450 aa  315  9e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292895  hitchhiker  0.00779909 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  39.87 
 
 
450 aa  315  9e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  39.41 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  41.33 
 
 
453 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  39.82 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  42.76 
 
 
447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  39.73 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  39.07 
 
 
451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  39.73 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  39.07 
 
 
451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  40.05 
 
 
447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  40.5 
 
 
448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  39.25 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  40.28 
 
 
450 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>