34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3776 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3739    85.77 
 
 		 860 bp  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3534    86.17 
 
 		 860 bp  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3776    100 
 
 		 823 bp  1631    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3184    85.77 
 
 		 860 bp  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0752    86.17 
 
 		 860 bp  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.874544  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0616    86.03 
 
 		 860 bp  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  90.71 
 
 		 822 bp  523  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4106    95.65 
 
 		 105 bp  151  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.412699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7359  putative transcriptional regulator  95.65 
 
 		 489 bp  151  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  88.19 
 
 		 702 bp  125  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  81.42 
 
 		 690 bp  121  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  81.42 
 
 		 708 bp  121  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  81.42 
 
 		 555 bp  121  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  81.42 
 
 		 708 bp  121  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  83.51 
 
 		 453 bp  119  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  81.51 
 
 		 870 bp  115  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  81.51 
 
 		 822 bp  115  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0893  transposase  81.71 
 
 		 177 bp  87.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0615  IS3 family transposase orfA  96.36 
 
 		 318 bp  85.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0753  hypothetical protein  96.36 
 
 		 318 bp  85.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3185  hypothetical protein  96.36 
 
 		 153 bp  85.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3533  IS3 family transposase orfA  96.36 
 
 		 318 bp  85.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3738  hypothetical protein  96.36 
 
 		 318 bp  85.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1197    86.9 
 
 		 381 bp  79.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 552 bp  71.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2024  transposase IS3/IS911 family protein  92.73 
 
 		 318 bp  69.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0878347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01380  integrase core domain protein  90.38 
 
 		 183 bp  63.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2227  insertion element hypothetical protein  79.88 
 
 		 177 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00152933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  92.11 
 
 		 1140 bp  52  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  92.11 
 
 		 1140 bp  52  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  92.11 
 
 		 1140 bp  52  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  92.11 
 
 		 1140 bp  52  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  92.11 
 
 		 1140 bp  52  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  91.67 
 
 		 621 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>