11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7359 on replicon NC_009008
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009008  RSP_7359  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  323  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  87.8 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  79.49 
 
 		 273 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  79.49 
 
 		 289 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  67.44 
 
 		 233 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  79.49 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  79.49 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  79.49 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  79.49 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  74.36 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  75 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>