28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3738 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3738  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3533  IS3 family transposase orfA  99.05 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0753  hypothetical protein  99.05 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0615  IS3 family transposase orfA  99.05 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2024  transposase IS3/IS911 family protein  97.14 
 
 		 105 aa  206  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0878347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2226  transposase  79.55 
 
 		 93 aa  146  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000869516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0892  transposase  79.55 
 
 		 88 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1775  transposase  76.14 
 
 		 88 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1594  transposase  76.14 
 
 		 83 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  59.41 
 
 		 102 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3187  IS3 family transposase orfA  90.91 
 
 		 64 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00296  transposase  73.97 
 
 		 74 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00171354  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3185  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4285  hypothetical protein  94.74 
 
 		 44 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2796  transposase  76.74 
 
 		 43 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  40.24 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.654544 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  33.72 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  33.72 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  33.72 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  33.72 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  34.88 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  31.52 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  22.62 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4750  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2230  transposase IS3/IS911  28 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000508714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>