12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3185 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3738  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0615  IS3 family transposase orfA  100 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0753  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3533  IS3 family transposase orfA  100 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2024  transposase IS3/IS911 family protein  98 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0878347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3185  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00296  transposase  75.51 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00171354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  64.58 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2226  transposase  81.82 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000869516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0892  transposase  81.82 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1775  transposase  72.73 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1594  transposase  72.73 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>