26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1775 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1775  transposase  100 
 
 		 88 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1594  transposase  100 
 
 		 83 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2226  transposase  91.4 
 
 		 93 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000869516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0892  transposase  90.91 
 
 		 88 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0615  IS3 family transposase orfA  76.14 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0753  hypothetical protein  76.14 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3533  IS3 family transposase orfA  76.14 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3738  hypothetical protein  76.14 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2024  transposase IS3/IS911 family protein  73.86 
 
 		 105 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0878347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  61.73 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3187  IS3 family transposase orfA  76.67 
 
 		 64 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00296  transposase  72.41 
 
 		 74 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00171354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2796  transposase  97.67 
 
 		 43 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4285  hypothetical protein  73.68 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  39.24 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.654544 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3185  hypothetical protein  72.73 
 
 		 50 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  36.92 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  36.92 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  36.92 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  36.92 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  36.92 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  36.92 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4750  hypothetical protein  34.18 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  24.62 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1400  hypothetical protein  37.31 
 
 		 92 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.212063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>