41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1471 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  224  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.654544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2024  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0878347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3533  IS3 family transposase orfA  40.24 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3738  hypothetical protein  40.24 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0753  hypothetical protein  40.24 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0615  IS3 family transposase orfA  40.24 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0892  transposase  40.51 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2226  transposase  40.51 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000869516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1775  transposase  39.24 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1594  transposase  39.24 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128024  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  28.42 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  28.42 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  28.42 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  28.42 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  28.42 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  28.42 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2519  hypothetical protein  32.56 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.769591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1004  hypothetical protein  32.56 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0555  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0867781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3082  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0762  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.631957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1355  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.18097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1847  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0847654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2392  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2127  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2139  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2170  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034388  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3187  IS3 family transposase orfA  42.59 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2280  ISGsu7, transposase OrfA  34.31 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8621  ISGsu7, transposase OrfA  37.84 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5626  ISGsu7, transposase OrfA  41.07 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6409  ISGsu7, transposase OrfA  35.82 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4288  ISGsu7, transposase OrfA  35.82 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1054  ISGsu7, transposase OrfA  35.82 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4097  hypothetical protein  37.04 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>