18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8621 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8621  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 
100 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6409  ISGsu7, transposase OrfA  87.8 
 
 
118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4288  ISGsu7, transposase OrfA  87.8 
 
 
118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1054  ISGsu7, transposase OrfA  87.8 
 
 
118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5626  ISGsu7, transposase OrfA  87.8 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2519  hypothetical protein  34.88 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.769591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1004  hypothetical protein  34.88 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3082  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0555  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0867781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2392  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2280  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2170  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2139  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2127  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1847  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0847654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1355  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.18097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0762  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.631957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  37.84 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.654544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>