23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1004 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013224  Dret_2519  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.769591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1004  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0762  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.631957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3082  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2392  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2280  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2139  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0555  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0867781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1355  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.18097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1847  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0847654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2127  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2170  ISGsu7, transposase OrfA  37.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  32.56 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.654544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1054  ISGsu7, transposase OrfA  39 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4288  ISGsu7, transposase OrfA  39 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6409  ISGsu7, transposase OrfA  39 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8621  ISGsu7, transposase OrfA  34.88 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5626  ISGsu7, transposase OrfA  39.56 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  32.14 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8191  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.7 
 
 		 212 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  30.7 
 
 		 492 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  26.74 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  26.74 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>