25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2139 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0762  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.631957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1355  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.18097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1847  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0847654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2127  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2139  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2170  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2280  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2392  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3082  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0555  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0867781  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2519  hypothetical protein  37.7 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.769591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1004  hypothetical protein  37.7 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939933 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6985  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  34.31 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.654544 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8621  ISGsu7, transposase OrfA  37.14 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1054  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4288  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6409  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  35.96 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  35.96 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  35.96 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5626  ISGsu7, transposase OrfA  39.18 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  35.96 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  35.96 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  35.96 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>