26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6409 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6409  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 
118 aa  221  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4288  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 
118 aa  221  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1054  ISGsu7, transposase OrfA  100 
 
 
118 aa  221  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5626  ISGsu7, transposase OrfA  87.29 
 
 
118 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8621  ISGsu7, transposase OrfA  85.23 
 
 
100 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2519  hypothetical protein  39 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.769591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1004  hypothetical protein  39 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0762  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.631957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3082  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0555  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0867781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1355  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.18097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1847  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0847654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2127  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2139  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2170  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2280  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2392  ISGsu7, transposase OrfA  40.4 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  32.53 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.654544 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  32.22 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  33.71 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  33.71 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  33.71 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  33.71 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  33.71 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  33.71 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  33.71 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>