22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3187 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3187  IS3 family transposase orfA  100 
 
 		 64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0615  IS3 family transposase orfA  92.42 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0753  hypothetical protein  92.42 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3533  IS3 family transposase orfA  92.42 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2024  transposase IS3/IS911 family protein  90.91 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0878347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3738  hypothetical protein  90.91 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1594  transposase  76.67 
 
 		 83 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1775  transposase  76.67 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2226  transposase  76.67 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000869516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0892  transposase  76.67 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4285  hypothetical protein  100 
 
 		 44 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2796  transposase  76.74 
 
 		 43 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  55.17 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  42.59 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.654544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00296  transposase  66.67 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00171354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 374 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 374 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 374 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>