13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00296 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00296  transposase  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00171354  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3738  hypothetical protein  73.97 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0615  IS3 family transposase orfA  73.97 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0753  hypothetical protein  73.97 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3533  IS3 family transposase orfA  73.97 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2024  transposase IS3/IS911 family protein  72.6 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0878347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2226  transposase  77.59 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000869516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0892  transposase  77.59 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1775  transposase  72.41 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1594  transposase  72.41 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  61.29 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3185  hypothetical protein  75.51 
 
 		 50 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3187  IS3 family transposase orfA  66.67 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>