32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2024 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2024  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 105 aa  213  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0878347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3533  IS3 family transposase orfA  98.1 
 
 		 105 aa  209  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0753  hypothetical protein  98.1 
 
 		 105 aa  209  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0615  IS3 family transposase orfA  98.1 
 
 		 105 aa  209  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3738  hypothetical protein  97.14 
 
 		 105 aa  206  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2226  transposase  77.27 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000869516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0892  transposase  77.27 
 
 		 88 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1775  transposase  73.86 
 
 		 88 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1594  transposase  73.86 
 
 		 83 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  61.29 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3187  IS3 family transposase orfA  90.91 
 
 		 64 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00296  transposase  72.6 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00171354  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3185  hypothetical protein  98 
 
 		 50 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4285  hypothetical protein  100 
 
 		 44 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2796  transposase  74.42 
 
 		 43 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.654544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 374 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 374 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  34.88 
 
 		 374 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 374 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  34.88 
 
 		 374 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  34.88 
 
 		 374 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  34.88 
 
 		 374 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  34.88 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4750  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  28.92 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  28.92 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  28.92 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  28.92 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  28.92 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  28.92 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  21.43 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>