20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2400 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  82.53 
 
 		 498 aa  671    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  940    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  82.13 
 
 		 498 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  43.8 
 
 		 491 aa  279  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  41.61 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  38.49 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  30.87 
 
 		 536 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  30.23 
 
 		 534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  35.27 
 
 		 526 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  30.06 
 
 		 533 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  43.27 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  29.71 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  36.95 
 
 		 506 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  29.21 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  31 
 
 		 363 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  30.58 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  39.39 
 
 		 866 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 294 aa  43.9  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00792158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 302 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.549204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>