40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2122 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2122  nuclease  100 
 
 		 288 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1278  nuclease  100 
 
 		 288 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4529  nuclease  37.05 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0644  ParB domain protein nuclease  32.32 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3038  transcriptional regulator protein  27.04 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  28.72 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  34.91 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  34.45 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  37.25 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.57 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  35.63 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2187  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.63 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  35 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  27.81 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  37.5 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  28.22 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  38.81 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  26.42 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  28.97 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  28.23 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  28.23 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  28.23 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  28.23 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  28.23 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  28.23 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  28.23 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  24.02 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  32.35 
 
 		 367 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  34.15 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  37.35 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  37.35 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  37.35 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  28.48 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  39.76 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  34.41 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2050  hypothetical protein  45.45 
 
 		 174 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0610873  hitchhiker  0.0013172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  27.42 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  27.42 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>