173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2038 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  88.89 
 
 		 379 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  89.15 
 
 		 379 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  100 
 
 		 379 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  53.11 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  53.59 
 
 		 376 aa  355  8.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  45.99 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  43.87 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  44.51 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  45.72 
 
 		 385 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  43.13 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  43.8 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  43.5 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2728  O-methyltransferase family protein  43.7 
 
 		 381 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  45.18 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  45.2 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  42.13 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  41.85 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3695  O-methyltransferase family protein  44.85 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  29.88 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  32.59 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.25 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.25 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.25 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.17 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.78 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.86 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.86 
 
 		 362 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.86 
 
 		 362 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  33.5 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  30.18 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  27.19 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  31.25 
 
 		 344 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  30.61 
 
 		 363 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.87 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  27.69 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  23.82 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  39.35 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  28.37 
 
 		 630 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.49 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  29.39 
 
 		 336 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  32.04 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.49 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  28.16 
 
 		 630 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.55 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  31.7 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.63 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  26.26 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.93 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  27.84 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  29.63 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  28.96 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.57 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  27.39 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  29.01 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3051  O-methyltransferase family 2  32.2 
 
 		 324 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  28.27 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  33.33 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  29.17 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  28.87 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  26.78 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  27.57 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  26.78 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  26.78 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  23.69 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  25.87 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  26.78 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  32.14 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  26.78 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  26.78 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  26.78 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  27.81 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  26.57 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  29.23 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  31.18 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  28.02 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  29.52 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  24.69 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  29.71 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  24.29 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  25.38 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  24.21 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  25.45 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  27.93 
 
 		 338 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  38.1 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  27.93 
 
 		 338 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  26.63 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  27.93 
 
 		 367 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  25.84 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  27.93 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  27.93 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  23.26 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  25.82 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  23.37 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  22.71 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  26.13 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  25.82 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  27.13 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  24.57 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  25.82 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>